MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus equi subsp. zooepidemicus

Total Repeats: 45420

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012470	T	6	6	20	25	0 %	100 %	0 %	0 %	225867618
2	NC_012470	AGCT	2	8	41	48	25 %	25 %	25 %	25 %	225867618
3	NC_012470	T	6	6	79	84	0 %	100 %	0 %	0 %	225867618
4	NC_012470	ATG	2	6	89	94	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225867618
5	NC_012470	CAA	2	6	125	130	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225867618
6	NC_012470	T	7	7	131	137	0 %	100 %	0 %	0 %	225867618
7	NC_012470	A	7	7	164	170	100 %	0 %	0 %	0 %	225867618
8	NC_012470	CAG	2	6	191	196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225867618
9	NC_012470	TGA	2	6	251	256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225867618
10	NC_012470	CAG	2	6	277	282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225867618
11	NC_012470	CAG	2	6	314	319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225867618
12	NC_012470	TGA	2	6	369	374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225867618
13	NC_012470	AAC	2	6	423	428	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225867618
14	NC_012470	TTTA	2	8	438	445	25 %	75 %	0 %	0 %	225867618
15	NC_012470	TTA	2	6	554	559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225867618
16	NC_012470	TGT	2	6	567	572	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225867618
17	NC_012470	TCC	2	6	629	634	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225867618
18	NC_012470	TGA	2	6	639	644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225867618
19	NC_012470	A	7	7	661	667	100 %	0 %	0 %	0 %	225867618
20	NC_012470	AAC	3	9	718	726	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225867618
21	NC_012470	AGA	2	6	777	782	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225867618
22	NC_012470	AGC	2	6	1020	1025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225867618
23	NC_012470	CA	3	6	1149	1154	50 %	0 %	0 %	50 %	225867618
24	NC_012470	TGCT	2	8	1163	1170	0 %	50 %	25 %	25 %	225867618
25	NC_012470	ATA	2	6	1208	1213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225867618
26	NC_012470	GGA	2	6	1240	1245	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225867618
27	NC_012470	A	6	6	1284	1289	100 %	0 %	0 %	0 %	225867618
28	NC_012470	AATTGA	2	12	1317	1328	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	225867618
29	NC_012470	CTA	5	15	1464	1478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_012470	TA	3	6	1490	1495	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_012470	TTCA	2	8	1540	1547	25 %	50 %	0 %	25 %	225867619
32	NC_012470	CAG	2	6	1575	1580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225867619
33	NC_012470	TTG	2	6	1708	1713	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225867619
34	NC_012470	T	6	6	1750	1755	0 %	100 %	0 %	0 %	225867619
35	NC_012470	GGT	2	6	1818	1823	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225867619
36	NC_012470	TGC	2	6	1962	1967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225867619
37	NC_012470	GTC	2	6	1982	1987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225867619
38	NC_012470	GA	3	6	2133	2138	50 %	0 %	50 %	0 %	225867619
39	NC_012470	GAT	2	6	2158	2163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225867619
40	NC_012470	TGA	2	6	2276	2281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225867619
41	NC_012470	AC	3	6	2309	2314	50 %	0 %	0 %	50 %	225867619
42	NC_012470	CTT	2	6	2343	2348	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225867619
43	NC_012470	GTG	2	6	2458	2463	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225867619
44	NC_012470	TTGA	2	8	2509	2516	25 %	50 %	25 %	0 %	225867619
45	NC_012470	GAT	2	6	2596	2601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225867619
46	NC_012470	AG	3	6	2604	2609	50 %	0 %	50 %	0 %	225867619
47	NC_012470	T	7	7	2672	2678	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_012470	ATAA	2	8	2685	2692	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_012470	TGAG	2	8	2706	2713	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_012470	TGAAA	2	10	2747	2756	60 %	20 %	20 %	0 %	225867620
51	NC_012470	A	6	6	2789	2794	100 %	0 %	0 %	0 %	225867620
52	NC_012470	GTC	2	6	2875	2880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225867620
53	NC_012470	GAA	2	6	2900	2905	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225867620
54	NC_012470	ATT	2	6	2963	2968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_012470	A	6	6	2996	3001	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_012470	GGT	2	6	3031	3036	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_012470	ATG	2	6	3042	3047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225867621
58	NC_012470	AAG	2	6	3069	3074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225867621
59	NC_012470	TTA	2	6	3259	3264	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225867621
60	NC_012470	TCT	2	6	3338	3343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225867621
61	NC_012470	TGT	2	6	3349	3354	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225867621
62	NC_012470	TTG	2	6	3369	3374	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225867621
63	NC_012470	TCT	2	6	3431	3436	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_012470	T	8	8	3436	3443	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_012470	A	6	6	3463	3468	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_012470	A	7	7	3483	3489	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_012470	CAG	2	6	3501	3506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225867622
68	NC_012470	GCT	2	6	3575	3580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225867622
69	NC_012470	TGGTA	2	10	3613	3622	20 %	40 %	40 %	0 %	225867622
70	NC_012470	A	7	7	3671	3677	100 %	0 %	0 %	0 %	225867622
71	NC_012470	TGT	2	6	3796	3801	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225867622
72	NC_012470	TGA	3	9	3811	3819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225867622
73	NC_012470	AATT	2	8	3894	3901	50 %	50 %	0 %	0 %	225867622
74	NC_012470	AATC	2	8	3915	3922	50 %	25 %	0 %	25 %	225867622
75	NC_012470	A	6	6	3945	3950	100 %	0 %	0 %	0 %	225867622
76	NC_012470	A	6	6	4002	4007	100 %	0 %	0 %	0 %	225867622
77	NC_012470	GAA	2	6	4022	4027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225867622
78	NC_012470	GAT	2	6	4058	4063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225867622
79	NC_012470	A	6	6	4068	4073	100 %	0 %	0 %	0 %	225867622
80	NC_012470	TTA	2	6	4091	4096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225867622
81	NC_012470	TGA	2	6	4129	4134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225867622
82	NC_012470	GCA	2	6	4190	4195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225867622
83	NC_012470	GTT	2	6	4211	4216	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225867622
84	NC_012470	AGA	3	9	4234	4242	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225867622
85	NC_012470	GAT	2	6	4256	4261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225867622
86	NC_012470	ACTTGG	2	12	4342	4353	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	225867622
87	NC_012470	GTGC	2	8	4382	4389	0 %	25 %	50 %	25 %	225867622
88	NC_012470	CAC	2	6	4416	4421	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225867622
89	NC_012470	AGC	2	6	4423	4428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225867622
90	NC_012470	ATG	2	6	4485	4490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225867622
91	NC_012470	GTC	2	6	4533	4538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225867622
92	NC_012470	AGGA	2	8	4545	4552	50 %	0 %	50 %	0 %	225867622
93	NC_012470	AT	3	6	4558	4563	50 %	50 %	0 %	0 %	225867622
94	NC_012470	GAA	2	6	4695	4700	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_012470	TAA	2	6	4714	4719	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_012470	GCT	2	6	4729	4734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_012470	TAG	2	6	4777	4782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225867623
98	NC_012470	CAAA	2	8	4812	4819	75 %	0 %	0 %	25 %	225867623
99	NC_012470	AGA	2	6	4880	4885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225867623
100	NC_012470	TTG	2	6	4903	4908	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225867623
101	NC_012470	ATCA	2	8	4920	4927	50 %	25 %	0 %	25 %	225867623
102	NC_012470	ATTT	2	8	4935	4942	25 %	75 %	0 %	0 %	225867623
103	NC_012470	AAT	2	6	4965	4970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225867623
104	NC_012470	TTG	2	6	4978	4983	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225867623
105	NC_012470	TAT	2	6	5001	5006	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225867623
106	NC_012470	ATG	2	6	5038	5043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225867623
107	NC_012470	G	6	6	5094	5099	0 %	0 %	100 %	0 %	225867623
108	NC_012470	ATT	2	6	5118	5123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225867623
109	NC_012470	TTA	2	6	5194	5199	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225867623
110	NC_012470	GAT	2	6	5226	5231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225867623
111	NC_012470	CAAT	2	8	5239	5246	50 %	25 %	0 %	25 %	225867623
112	NC_012470	TAT	2	6	5280	5285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225867623
113	NC_012470	A	6	6	5293	5298	100 %	0 %	0 %	0 %	225867623
114	NC_012470	GCA	2	6	5315	5320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225867623
115	NC_012470	ATT	2	6	5350	5355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225867624
116	NC_012470	AGC	3	9	5443	5451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225867624
117	NC_012470	GTG	2	6	5492	5497	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225867624
118	NC_012470	CTTG	2	8	5545	5552	0 %	50 %	25 %	25 %	225867624
119	NC_012470	T	6	6	5573	5578	0 %	100 %	0 %	0 %	225867624
120	NC_012470	GAT	2	6	5582	5587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225867624
121	NC_012470	CTG	2	6	5589	5594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225867624
122	NC_012470	T	6	6	5653	5658	0 %	100 %	0 %	0 %	225867624
123	NC_012470	TTAGC	2	10	5691	5700	20 %	40 %	20 %	20 %	225867624
124	NC_012470	CAG	2	6	5738	5743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225867624
125	NC_012470	AAG	2	6	5795	5800	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225867624
126	NC_012470	T	6	6	5918	5923	0 %	100 %	0 %	0 %	225867624
127	NC_012470	TGA	2	6	5926	5931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225867624
128	NC_012470	TC	3	6	5972	5977	0 %	50 %	0 %	50 %	225867624
129	NC_012470	AGGA	2	8	5981	5988	50 %	0 %	50 %	0 %	225867624
130	NC_012470	GGA	2	6	6031	6036	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225867624
131	NC_012470	AGC	2	6	6066	6071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225867624
132	NC_012470	GGA	2	6	6106	6111	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225867624
133	NC_012470	AAG	2	6	6129	6134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225867624
134	NC_012470	AATG	2	8	6182	6189	50 %	25 %	25 %	0 %	225867624
135	NC_012470	T	6	6	6227	6232	0 %	100 %	0 %	0 %	225867624
136	NC_012470	GAT	2	6	6233	6238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225867624
137	NC_012470	AGTT	2	8	6246	6253	25 %	50 %	25 %	0 %	225867624
138	NC_012470	TTG	2	6	6290	6295	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225867624
139	NC_012470	GAT	2	6	6299	6304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225867624
140	NC_012470	ATT	2	6	6336	6341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225867624
141	NC_012470	CTT	2	6	6385	6390	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225867624
142	NC_012470	TCAA	2	8	6471	6478	50 %	25 %	0 %	25 %	225867624
143	NC_012470	TGA	2	6	6493	6498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225867624
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145	NC_012470	CTG	2	6	6615	6620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225867624
146	NC_012470	ATT	2	6	6650	6655	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225867624
147	NC_012470	TGA	2	6	6685	6690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225867624
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149	NC_012470	CGT	2	6	6740	6745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225867624
150	NC_012470	TCG	2	6	6748	6753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225867624
151	NC_012470	T	6	6	6844	6849	0 %	100 %	0 %	0 %	225867624
152	NC_012470	CAG	2	6	6908	6913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225867624
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155	NC_012470	CAAAG	2	10	7026	7035	60 %	0 %	20 %	20 %	225867624
156	NC_012470	GAT	2	6	7124	7129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225867624
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162	NC_012470	A	6	6	7465	7470	100 %	0 %	0 %	0 %	225867624
163	NC_012470	ATT	3	9	7484	7492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225867624
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165	NC_012470	TGA	2	6	7552	7557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225867624
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176	NC_012470	AT	3	6	8238	8243	50 %	50 %	0 %	0 %	225867624
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254	NC_012470	TAT	2	6	11617	11622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225867629
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259	NC_012470	TGA	2	6	11889	11894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225867629
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262	NC_012470	CTA	2	6	12036	12041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225867629
263	NC_012470	GCTT	2	8	12119	12126	0 %	50 %	25 %	25 %	225867629
264	NC_012470	TCT	2	6	12127	12132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225867629
265	NC_012470	GCA	3	9	12136	12144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225867629
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267	NC_012470	ATT	2	6	12181	12186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225867629
268	NC_012470	TGA	2	6	12210	12215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225867629
269	NC_012470	A	6	6	12228	12233	100 %	0 %	0 %	0 %	225867629
270	NC_012470	ATG	2	6	12284	12289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225867629
271	NC_012470	TTATC	2	10	12317	12326	20 %	60 %	0 %	20 %	225867629
272	NC_012470	GAC	2	6	12352	12357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225867629
273	NC_012470	CAT	2	6	12419	12424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225867630
274	NC_012470	A	6	6	12425	12430	100 %	0 %	0 %	0 %	225867630
275	NC_012470	TCA	2	6	12449	12454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225867630
276	NC_012470	TGG	2	6	12476	12481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225867630
277	NC_012470	TGC	2	6	12499	12504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225867630
278	NC_012470	CTAT	2	8	12634	12641	25 %	50 %	0 %	25 %	225867630
279	NC_012470	TGC	2	6	12674	12679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225867630
280	NC_012470	T	6	6	12699	12704	0 %	100 %	0 %	0 %	225867630
281	NC_012470	GAA	2	6	12705	12710	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225867630
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285	NC_012470	TGA	2	6	12758	12763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225867630
286	NC_012470	TGA	2	6	12781	12786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225867630
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288	NC_012470	AGA	2	6	12887	12892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225867630
289	NC_012470	TCA	2	6	12962	12967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225867630
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294	NC_012470	ATT	2	6	13144	13149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225867630
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297	NC_012470	TGA	2	6	13190	13195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225867630
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300	NC_012470	A	7	7	13287	13293	100 %	0 %	0 %	0 %	225867630
301	NC_012470	TGACT	2	10	13385	13394	20 %	40 %	20 %	20 %	225867630
302	NC_012470	TA	3	6	13423	13428	50 %	50 %	0 %	0 %	225867630
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374	NC_012470	ATT	2	6	16232	16237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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376	NC_012470	T	6	6	16273	16278	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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389	NC_012470	T	6	6	17067	17072	0 %	100 %	0 %	0 %	225867633
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391	NC_012470	GTATT	2	10	17146	17155	20 %	60 %	20 %	0 %	225867633
392	NC_012470	GCA	2	6	17283	17288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225867633
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395	NC_012470	GTT	2	6	17451	17456	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225867633
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397	NC_012470	A	6	6	17573	17578	100 %	0 %	0 %	0 %	225867633
398	NC_012470	TAT	3	9	17642	17650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225867633
399	NC_012470	AAGA	2	8	17758	17765	75 %	0 %	25 %	0 %	225867633
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401	NC_012470	A	6	6	17855	17860	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
402	NC_012470	A	7	7	17864	17870	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
403	NC_012470	GAC	2	6	17948	17953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
404	NC_012470	AG	3	6	18041	18046	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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407	NC_012470	CGA	2	6	18323	18328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
408	NC_012470	GCA	2	6	18397	18402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
409	NC_012470	G	6	6	18422	18427	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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412	NC_012470	TGT	2	6	18483	18488	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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418	NC_012470	AT	3	6	18750	18755	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
419	NC_012470	GGA	2	6	18756	18761	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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426	NC_012470	CAT	2	6	19176	19181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
427	NC_012470	TAA	2	6	19211	19216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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431	NC_012470	TGGT	2	8	19286	19293	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
432	NC_012470	CGC	2	6	19410	19415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
433	NC_012470	AC	3	6	19440	19445	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
434	NC_012470	CAC	2	6	19455	19460	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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436	NC_012470	GAT	2	6	19526	19531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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441	NC_012470	CA	3	6	19795	19800	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
442	NC_012470	T	6	6	19813	19818	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
443	NC_012470	AAG	2	6	19822	19827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
444	NC_012470	ATC	3	9	19888	19896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
445	NC_012470	AGA	2	6	19943	19948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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